Når du bestemmer deg for når du skal starte syklusen manuelt, avhenger av dine unike omstendigheter. I Clue Logging er syklusen din opp til deg. Du kan for eksempel starte en ny syklus når du bytter p-plaster eller p-ring, begynner på en ny pakke med p-piller, tar en testosteronsprøyte eller justerer dosen av hormonbehandling. Ved å følge med på opplevelser som humørsvingninger, ømme bryster, energiskift eller pletblødninger i noen måneder kan du oppdage mønstre og legge merke til eventuelle endringer. Noen velger kanskje å starte en ny syklus hver gang de merker en endring i de fysiske eller følelsesmessige opplevelsene, slik at de kan begynne å spore tilbakevendende mønstre på nytt. Jo mer du loggfører, desto tydeligere vil syklusmønstrene dine bli.